Xuất bản cây tiến hóa

Phylogeny xuất phát từ sự kết hợp hai từ gốc Hy Lạp: Phylo nghĩa là stem tức trực hệ (tuyến tính của một dòng họ) và genesis tức là nguồn gốc – tạm dịch phylogeny là sự phát sinh chủng lòai. Tính từ của nó là phylogenetic

Trong ngành molecular phylogeny, người ta nghiên cứu mối quan hệ giữa các lòai sinh vật thông qua các bằng chứng phân tử, cụ thể là trình tự DNA và protein. Như vậy sự khác biệt giữa các trình tự (DNA) chỉ định sự phân kỳ di truyền như là kết quả của tiến hóa phân tử theo tiến trình thời gian.

Các phương pháp dùng để nghiên cứu phát sinh chủng lòai chủ yếu dựa trên một sự giả định về các tiến trình tiến hóa ở mức phân tử thông qua việc quan sát phân tích trình tự DNA hoặc protein. Bằng cách sử dụng cộng cụ máy tính, các chuỗi dữ liệu sẽ được mô phỏng tiến trình tiến hóa và phân tích tiến trình phát sinh chủng lòai. Giả sử là chúng ta có một „cây tiến hóa đúng“, chúng ta có thể dùng nó để để kiểm tra lại độ chính xác, tính nhất quán khả năng tin cậy của những mô hình tiến hóa. Tuy nhiên khi sử dụng các dữ liệu sinh học, cái gọi là cây tiến hóa có thể không bao giờ có, hoặc ít ra cũng có thể nói là KHÔNG BIẾT. Do vậy người ta chấp nhận một cây tiến hóa được dựng nên mà người ta tin là nó GIỐNG NHẤT với cây tiến hóa đúng.

Các trình tự cơ bản để cho một nghiên cứu phát sinh chủng lòai phân tử

Tùy thuộc nhiều vấn đề mà các bước của một nghiên cứu phát sinh chủng lòai phân tử có thể thiết lập khác nhau, nhưng cơ bản nó gồm các bước sau: